بدأ باقر حياته المهنية في شركة ديلويت بالمملكة العربية السعودية في عام 1995 كمساعد مدير يقدم خدمات التدقيق والضمان للعملاء المحليين ومتعددي الجنسيات. في عام 1999، انضم باقر إلى شركة إف إم تامر وشركاه، إحدى الشركات الرائدة في مجال توزيع الأدوية والمستلزمات الطبية في المملكة العربية السعودية، كمدير للتدقيق الداخلي.
لقد مهدت خبرة باقر ومعرفته الغنية الطريق أمامه للانتقال من منصب المدير المالي لشركة إف إم. تامر وشركاه (أعمال التوزيع) في عام 2001 إلى المدير المالي لمجموعة تامر في عام 2004. انضم باقر إلى مجموعة علي زيد القريشي وإخوانه كمدير مالي للمجموعة في عام 2008 حيث أسس وظيفة تمويل المجموعة لدعم الشركات التابعة لمجموعة علي زيد القريشي وإخوانه والمصالح الاستراتيجية لها.
باقر هو أيضًا عضو في معهد المحاسبين القانونيين في باكستان، والمعهد القانوني للمحاسبين الإداريين في المملكة المتحدة، وقد حضر برنامج الإدارة المتقدمة من كلية إنسياد.
